补卡后是否算全勤，主要取决于公司具体规章制度。从法律角度看，根据《劳动合同法》，用人单位应保障劳动者权利，制定规章制度时需与工会或职工代表协商确定，并公示或告知劳动者。若公司规定补卡后全勤奖取消，但该规定未经合法程序制定或损害劳动者权益，可能无效。若公司因补卡取消全勤奖，且该规定不合理或未明确告知，则可能构成对员工权益的侵害。若公司因此类问题频繁与员工发生纠纷，或员工因此遭受较大经济损失，表明问题比较严重了，应及时寻求专业人士的进一步解决。
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从法律角度，针对公司规定补卡后全勤奖取消的情况，常见的处理方式包括：1. 与公司沟通协商，争取恢复全勤奖或得到合理补偿；2. 若沟通无果，可以向当地劳动监察部门投诉，寻求其介入调查；3. 必要时，寻求法律援助，通过法律途径维权。选择处理方式时，建议优先考虑沟通协商，这通常是最直接且成本较低的方式。若协商无果，再考虑向相关部门投诉或寻求法律援助。
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从法律角度，针对补卡后全勤奖问题，在不同情况下可采取以下具体操作：1. 若公司规章制度明确规定补卡后不影响全勤，但实际操作中取消全勤，员工应收集相关证据（如规章制度文本、打卡记录等），与公司人力资源部门沟通，要求恢复全勤。2. 若公司规章制度未明确规定补卡后是否影响全勤，员工可提出合理诉求，与公司协商制定明确规则，或争取在补卡后仍获得全勤奖励。3. 若公司规章制度不合理地取消了补卡后的全勤奖励，且拒绝与员工协商，员工可向当地劳动监察部门投诉，并提交相关证据。劳动监察部门将调查核实，并可能对公司进行处罚或要求公司恢复员工权益。4. 若投诉无果，员工可考虑寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。在此过程中，员工应咨询专业律师，了解具体法律程序和维权策略。