员工有权利依法辞职，任何协议限制其辞职都是不合法的。《劳动合同法》规定，劳动者有权利提前通知用人单位解除劳动合同。若劳动合同中存在禁止辞职的条款，这些条款是无效的。企业忽视这一点可能会面临法律风险，且不利于维护良好的员工关系和企业声誉。
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针对劳动合同中禁止员工辞职的条款，企业应采取以下措施：一是宣布这些条款无效，严格遵守《劳动合同法》的规定；二是与员工重新协商劳动合同，删除不合法的条款。选择何种方式取决于具体情况，但保障员工权益和合同合法性是关键。